“扩大DNA数据存储的首要障碍”
北卡罗来纳州立大学的研究人员开发了一种用基于dna的新闻存储系统对数据文件进行标记和检索的新技术,处理了广泛使用dna数据存储技术的两个首要障碍。
dna系统因其潜在的新闻存储密度而具有吸引力; 理论上,它可以存储相当大的以前存储在电子设备中的数据量的10亿倍。 詹姆斯·塔克说,他是关于这项工作的论文的联合通讯作者。 北卡罗来纳州电气和计算机工程副教授。
但是,这里面临的两大挑战是如何识别含有你要找的文件的dna链。 识别了这些链之后,如何将其删除以供浏览? 另外,没有破坏股票吗?
在以前的事业中,提出了将较短的20个单倍体长的dna序列称为引物结合序列,保存新闻的dna链末端的系统。 该论文的共同作者albert keung说。 北卡罗来纳州化学生物分子工程助理教授。 使用与对应引物的结合序列一致的小的dna引物,可以鉴定包含期望文件的适当的链。 但是,这些结合序列估计只有30,000个,不足以实用化。 我们想找到克服这个极限的方法。
为了处理这些问题,研究人员开发了dna浓缩和嵌套分离,或者称为dense的两种技术。
研究人员用两个嵌套的引物结合序列处理了文件识别的课题。 首先,它标识所有链,包括初始联接序列。 然后,第二次搜索子集,并选择包含第二个组合序列的链。
据此,估计文件名的数量从约30,000增加到约9亿,塔克说。
明确后,需要提取文件。 目前,利用聚合酶链反应( pcr )制作相关dna链的多个)和大量的)拷贝,然后对整个样本进行测序。 由于复制了很多靶dna链,这些信号压倒了样本中剩下的链,可以识别靶dna序列来读取文件。
该技术效率不高,如果尝试从大容量数据库中获取数据,将无法正常工作。 系统中其他的dna太多了。 kyle tomek博士说。 他是北卡罗来纳州立大学的学生,是这篇论文的共同主要作者。
因此,研究人员使用不同的数据检索方法,将几个小分子标记的任意一个附加到了用于鉴定靶dna链的引物上。 引物找到目标dna后,用pcr制作相关dna的拷贝,并将拷贝附加在分子标签上。
研究人员还利用了涂有与特定标签特异性结合的分子的磁性微珠。 这些功能化的微珠会扯下靶dna链的标签。 然后,用磁铁取出微珠,用它们可以带来目标dna。
该系统无需制作每个链的多个副本,即可获取与特定文件相关的dna链,还可以保存数据库中的原始dna链。 keung先生说。
我们已经说明了利用样本文件实验性地实现了dense系统,可以用于拷贝和图像文件的保存和检索,keung补充说。
tomek说,这些技术串联实施后,为开发具有现代容量和文件访问功能的基于dna的数据存储系统打开了大门。
下一步包括扩大规模,采用更大的数据库测试dense方法。 tuck先生说。 价格面临着巨大的挑战。
这篇论文推动了基于dna的新闻存储系统的扩展性在acs synthetic biology期刊上的发表。 这篇论文的共同第一人是kevin volkel,博士。 纽约州的学生。 这篇论文是北卡罗来纳州立大学前研究生alexander simpson共同撰写的。 还有北卡罗来纳州立大学的本科生austin hass和elaine indermaur。
这项事业是在国家科学基金会的资助号码为1650148的情况下完成的。
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